1- نزهه الانفس و روضه المجلس اثر محمّدبن علی عراقی، تحریر صفر 590ق، در امثال عرب .نسخة منحصر بفرد.
2- تفسیر فارسی (سورة اعراف تا مریم) مؤلّف و کاتب : ناشناس( گویا از سدة 5 ق)
3- تفسیر الموجز : اثرو به خطّ ابوالفتوح عجلی (515 تا600ق ) در سدة 6 ق . نسخة منحصر به فرد.
4- الجامع لصنعه التریاق: اثر نورالدّین ابوالحسن علی بن عبدالعظیم انصاری، متطبّب، تألیف 669ق، کتابت 670 ق. در طبّ فارسی.
5- منتهی المطلب فی تحقیق المذهب : اثر و خطّ علّامه حلّی، تحریر 678 ق.
6- المختارات من الرسائل، مجموعه منشآت از سده های 5 تا ق.کتابت 693 ق.
7- قرآن مجید به خطّ جلال جعفری، تحریر 712ق.
8- تذکرة سویدیّه: اثر ابن طرخان طبیب، تحریر، 715ق، در طبّ عمومی. امتیاز بزرگ کتاب در این است که هفت موضع سرطانی راکشف و داروهای آن را به تفصیل بیان کرده است.
9- صحاح اللغه: اثر ابونصر اسماعیل بن حمادجوهری، تحریر 763ق.
10- القانون فی الطب : اثر ابوعلی سینا، تحریر سدة 7ق.
11- تحریر المجسطی: اثرخواجه نصیر الدّین طوسی، در سده 9ق.
12- قرآن مجید (سوره الرّحمن تا آخر قرآن) تحریر 880ق، 28 برگ 15 سطری، دارای سرلوح مذّهب و جلد سوختة نفیس.
13- تذکرة نصرآبادی: اثر محمّدطاهر نصرآبادی. به امضای مؤلّف، تحریر 1091 ق.
14- دیوان حافظ: تحریر عهد صفویّه، با 14 لوحة مینیاتور بسیارممتاز، اثر مینیاتورگران اصفهانی، دارای تذهیب و تشعیر، با جلد مقوّایی روغنی و گل بوتة رنگین.
15- سفینه النجاه (تفسیر فارسی ، از سورة عنکبوت تا سوره انا فتحنا) اثر ملّا مقیما یزدی.
16- اصول کافی: اثر علّامه مجلسی، با اجازه قرائت و مقابله به خطّ مؤلّف.
17- محضر الشهود فی ردّ الیهود: اثر حاجی بابا قزوینی یزدی، در 1211ق.
18- تورات مقدّس، به زبان عبری با خطّ نسخ و ترجمة فارسی، نوشتة محمّد کاظم الحسینی (نسخة منحصر بفرد).
19- تذکرة شبستان: اثر محمّدعلی مدرّس یزدی «شهلا یزدی» تألیف و تحریر 1276ق. در شرح احوال و اشعار شعرای ایران، بویژه یزد. نسخة منحصر بفرد.
20- جامع اللغات: اثر محمّدجعفر ندوشنی یزدی، در سده 13ق، فرهنگ عربی به فارسی (نسخة منحصر بفرد).
21- خاطرات نوّاب وکیل، اثر سید محمّد رضوی« وکیل التّولیّه» به خطّ مؤلّف در سدة 14ق ،( نسخة منحصر بفرد).
22- مجمع الجواهر: گردآوری سیدعلی محمّد وزیری یزدی، 4 دفتر، 430برگ.
مجموعه نامه ها، یادداشت ها و دست نوشته های بسیاری از علما و مراجع و دانشمندان اسلامی، دستخطّ 360 نفر از بزرگان اسلامی ازجمله آیات عظام و کرام : سید ابوالحسن اصفهانی، سیدمحمّدکاظم طباطبایی یزدی، حاج آقاحسین بروجردی، سیدعبدالله شیرازی، سیدشهاب الدّین مرعشی نجفی، سید محمّدرضا گلپایگانی، و امام خمینی دیده میشودکه اتّفاقاً کهن ترین دست نوشته امام خمینی به تاریخ 11 جمادی الاول 1363 ق ، در این مجموعه وجود دارد.