مجموعه ارزشمندی از نسخه ‌های خطی، چاپ سنگی و چاپی نفیس از حضرت جوادالأئمه (ع) شامل احادیث و روایات، ادعیه و زیارات، حرز حضرت و ... در کتابخانه مرکزی آستان قدس رضوی نگهداری می‌شود که به بیان فضائل و مکارم اخلاق و سیره ایشان پرداخته است.

 نسخه خطی بحارالانوار علامه مجلسی یکی از نسخه‌ های خطی نفیس موجود در گنجینه رضوی است که مشتمل بر احوال و مناقب و فضایل حضرت امام جواد(ع) است.
این نسخه، جلد دوازدهم بحارالانوار است که در سال 1077 هجری تألیف شده است. «بسمله الحمد لله الذى زيّن سمآء الدين بالشمس و القمر» آغازگر این نسخه و «و اهل بيته الطاهرين» پایان آن است.
اثر مذکور در‌ 158 برگ 5/25×16 سانتی متری به خط نسخ و در 13 سطر نگاشته شده و در مرداد ماه 1311 توسط رضا نائينى وقف آستان قدس رضوی شده است.
نسخه خطی دیگری نیز در گنجینه نسخ خطی گنجینه رضوی نگهداری می شود که قرن 12 هجری به خط نسخ در 31صفحه کتابت شده و توسط سید جلال الدین تهرانی وقف آستان قدس رضوی شده است.
همچنین نسخه نفیس دیگری که مشتمل بر حرز امام جواد (ع) است با عنوان احراز ائمه اطهار(ع) در این کتابخانه نگهداری می شود که به زبان عربی و شامل حرزهای چهارده معصوم علیهم السلام بوده که از مهج الدعوات ابن طاووس نقل شده است.
این نسخه نفیس که با «بسمله، بسم الله استر عنک ربک بالواحد من شر کل حاسد» آغاز و با «وسوسۀ او نقض فی دین او معیشه» پایان پیدا می کند به شکل طومار است که ابعاد آن 90×70 سانتی متر بوده و به خط نسخ جلی و خفی با مرکب مشکی و لاجورد و سیلو و سرخی در سده 14 هجری قمری کتابت و توسط اسدالله علم در خرداد 1362وقف آستان مقدس رضوی شده است.
نسخه خطی نفیس دیگری نیز به زبان عربی در این گنجینه موجود است که دارای حرز امام جواد‌(ع) بوده و با عنوان ادعیه شناسانده شده و حسین شریف گلپایگانی جامع و کاتب آن است. این نسخه مشتمل بر دعای جوشن کبیر و حرز امام جواد‌(ع) و از ادعیه معروف و مندرج در کتب ادعیه معتبره امامیه و بی نیاز از بسط گفتار است.
این اثر به خط نسخ خفی با مرکب مشکی کتابت شده و توسط عزیزالله صیدی در شهریور‌1357 وقف این آستان شده است. 
گفتنی است مرکز نسخ خطی سازمان کتابخانه‎ها، موزه‎ها و مرکز اسناد آستان قدس رضوی، دارای مصاحف شریف و نسخه‎های خطی بسیار ارزشمندی در موضوع‎های اخبار، ادعیه، ادبیات، تفسیر، تجوید، حکمت، کلام، تاریخ، جغرافیا، منطق، فقه، لغت، صرف و نحو و اخلاق به زبان‎های عربی، فارسی ، اردو، ترکی است و در حال حاضر 57 هزار نسخه خطی، 52 هزار کتاب چاپ سنگی در گنجینه خود نگهداری می کند.