سنت استخلاف یکی دیگر از سنتهای الهی که حاکم بر حیات انسان ها و در طی قصص قرآن بدان اشاره شده است. سنت حاکمیت صالحان بر زمین است طبق این سنت پیروزی نهایی از آن صالحان بوده و تنها آنها حکام برزمین خواهند شد.

وَ نُرِيدُ أَنْ نَمُنَّ عَلَى الَّذِينَ اسْتُضْعِفُوا فِي الْأَرْضِ وَ نَجْعَلَهُمْ أَئِمَّةً وَ نَجْعَلَهُمُ الْوارِثِينَ «5»

و ما اراده كرده‌ايم بر كسانى كه در زمين به ضعف و زبونى كشيده شدند، منّت گذاريم و آنان را پيشوايان و وارثان (روى زمين) قرار دهيم.

ایه فوق به این سنت قطعی اشاره می کند که در مبارزه همیشگی میان حق و باطل، استضعاف و استکبار مومن و کافر، پیروزی از آن مستضعفان و مومنان بوده و بساط ناپاکان و مستکبران سرانجام برچیده خواهد شد.

و همچنین خداوند متعال در سوره نور آیه 55 می فرماید: خداوند به کسانی که از شما ایمان آورده و عمل صالح انجام داده اند وعده کرده است آنها را در زمین به خلافت برساند.